Geschäftsführer der IBA Hamburg GmbH ist Uli Hellweg. Der Architekt und Stadtplaner hat als Geschäftsführer der landeseigenen Wasserstadt GmbH in Berlin die städtebauliche Umnutzung von 253 Hektar ehemaliger Industrie- und Hafenflächen an Spree und Havel verantwortet. Ebenfalls in Berlin machte Hellweg seine ersten IBA-Erfahrungen.

Im Rahmen der Internationalen Bauausstellung 1984/87 war er für die Betreuung von Pilotprojekten in der Altbauerneuerung und für die Leitung des Stadterneuerungsgebietes Berlin Moabit zuständig. Von 1992 bis 1996 arbeitete Uli Hellweg als Stadtbaurat in Kassel und initiierte u.a. die  mehrfach preisgekrönte Wiedergründung der Kasseler Unterneustadt. Hellweg verfügt über internationale Erfahrungen und Kontakte. In den Jahren 2001 bis 2005 baute er im Auftrag des Großherzogtums Luxemburg und der ARBED/ARCELOR-Gruppe den luxemburgisch-französischen Entwicklungsträger agora s.a.r.l. auf, der für die Neuentwicklung von 600 Hektar alter Industrieflächen verantwortlich zeichnet. In Esch-sur-Alzette in der Nähe von Luxemburg wurden unter seiner Leitung 130 Hektar Stahlindustrieflächen in Standorte für die erste Luxemburgische Universität sowie für Wohnen und Arbeiten umgewandelt. Hellweg hatte bereits 1998 mit einem anderen Hamburger Großprojekt zu tun: Damals leitete er als Vorsitzender die Jury des städtebaulichen Realisierungswettbewerbs HafenCity.

Hellwegs Partner in der Geschäftsführung der IBA Hamburg GmbH ist Heiner Baumgarten, selbst Geschäftsführungs-Vorsitzender der igs 2013 internationale gartenschau Hamburg 2013 GmbH. Baumgarten, gelernter Gärtner und Diplom-Ingenieur für Landespflege, arbeitete als Landschaftsplaner in verschiedenen Planungsbüros. Er war Referatsleiter im Amt für Landschaftsplanung in der Umweltbehörde Hamburg, später Abteilungsleiter im Garten- und Friedhofsamt und danach Fachamtsleiter Stadtgrün und Erholung. Baumgarten gehörte zeitweilig dem Aufsichtsrat Hamburger Friedhöfe AöR an. Seine beruflichen Schwerpunkte lagen unter anderem in der Konzeptentwicklung und Realisierung des Umweltzentrums Karlshöhe in Bramfeld; auch befasste sich Baumgarten mit der Konzeptionierung landschaftsnaher Gewerbeparks als Alternative zum Gewerbegebiet. Seine jetzige Funktion als Chef der igs übt Baumgarten seit Januar 2006 aus.